THÔNG TIN VỀ CÁC KẾT LUẬN MỚI CỦA LUẬN ÁN

Đề tài luận án: “Nghiên cứu sự lưu hành và đặc điểm phân tử của một số vi rút coxsackie và echo ở trẻ em nghi mắc Tay Chân Miệng tại Miền Bắc Việt Nam, 2008-2018”

Chuyên ngành:  Vi sinh vật học                                                 Mã số: 9 72 07 01

Họ và tên nghiên cứu sinh: Tạ Thị Thu Hồng                            Khóa đào tạo: K37

Họ và tên người hướng dẫn khoa học:  1. TS. Trần Thị Nguyễn Hòa

                                                                    2. TS. Dương Công Thành

Cơ sở đào tạo: Viện Vệ sinh Dịch tễ Trung ương

Tóm tắt những kết luận mới của luận án:

1. Đặc điểm lưu hành của các VRĐR “ngoài EV-A71” ở trẻ em mắc TCM tại miền Bắc Việt Nam, giai đoạn 2008-2018

• EV-A71, CV-A6 và CV-A16 là các týp vi rút đường ruột (VRĐR)chính gây bệnh Tay chân miệng (TCM) ở trẻ dưới 5 tuổi. Nghiên cứu cho thấy tầm quan trọng của các tác nhân VRĐR “ngoài EV-A71” khi chiếm tới hai phần ba số mẫu dương tính (1691/2603 mẫu, 64,96%).
• Sự lưu hành của CV-A16 có tính chu kỳ rõ ràng với các đỉnh kéo dài khoảng 1-2 năm (năm 2014, 2016-2017). Tương tự CV-A16, EV-A71 cũng lưu hành mang tính chu kỳ với các đỉnh sóng được mở rộng trong khoảng 2-3 năm (2011-2013, 2015-2016). Sự lưu hành của CV-A16 mang tính chất “đảo nghịch” với chu kỳ lưu hành của EV-A71. Năm CV-A16 ở “đỉnh” cao luôn xảy ra đồng thời với điểm “đáy” của EV-A71 và ngược lại.
• Về độ tuổi nhiễm bệnh, hai týp VRĐR “mới nổi” CV-A6 và CV-A10 có xu hướng “trẻ hóa” so với tác nhân “truyền thống” EV-A71 và CV-A16.

2. Đặc điểm di truyền phân tử vùng VP1 của CV-A6, CV-A16, CV-A10, CV-A2, CV-A4, E-18 và CV-A24, giai đoạn 2008-2018 

• Phân tích cây phát sinh chủng loài cho thấy CV-A6 và CV-A16 đã và đang thuộc các sub genogroup lớn nhất và gồm các chủng CV-A6 và CV-A16 lưu hành gây bệnh TCM trên thế giới hơn một thập niên trở lại. 98,03% mẫu CV-A6 thuộc CV-A6_D3 và 93,89% mẫu CV-A16 thuộc CV-A16_B1a. Trình tự aa trên các vùng chức năng VP1 của CV-A6 và CV-A16 tại Việt Nam tương đối bảo thủ. 77,8% số mẫu CV-A6 mang kiểu hình “CV-A6/N137-featuring”, là kiểu hình chiếm ưu thế (62,31%) của CV-A6 trên toàn thế giới. 80,15% mẫu CV-A16 mang đột biến K164, là kiểu hình xếp thứ hai (4,88%) của CV-A16 trên thế giới. Kiểu hình chiếm ưu thế “T164 featuring polymorphism” trên toàn cầu (72,88%) chỉ đứng thứ 2 (19,84%) trong tổng số CV-A16. Phát hiện này gợi ý rằng việc phát triển một loại vắc-xin phòng bệnh TCM phổ cập, ít nhất là ở Việt Nam, phải nhằm vào CV-A6 và CV-A16 là hai trong số ba týp huyết thanh chính gây bệnh. Các chủng phân lập của Việt Nam có thể được xem xét để thiết kế vắc-xin hợp lý.
• Týp CV-A10 đều thuộc về genotype lớn nhất (genotype C); bao gồm các chủng phân lập từ bệnh nhân mắc TCM ở một số quốc gia khác. 82,61% (38/46 chủng) CV-A10 từ năm 2008-2018 thuộc về “VNM lineage”. Có sự mới nổi của CV-A10_CHN lineage với 7/13 chủng (53,84%) CV-A10 thu thập năm 2018.
• CV-A2, CV-A4 tại miền Bắc Việt Nam thuộc sub genotype phổ biến lưu hành trên thế giới (88,89% CV-A2 thuộc sub-genotype C3 và 84,61% CV-A4 thuộc sub-genotype C2). Tương tự CV-A10, chủng có xu hướng hình thành nên dòng lưu hành mang tính địa phương (local lineage)
• 100% mẫu E-18 phân nhóm gen lớn nhất 5-3, chứa các mẫu E-18 phân lập từ bệnh nhân VN/VMN trên thế giới từ năm 2004 và từ bệnh nhân TCM ở Trung Quốc năm 2015 - 2016. 100% mẫu CV-A24 thuộc phân nhóm gen lớn nhất GIV–C5, chứa các chủng CV-A24v gây dịch viêm kết mạc.
• Nghiên cứu trên CV-A2, CV-A4, E-18 và CV-A24 đã cung cấp bằng chứng về xu hướng bổ sung/chuyển đổi đặc tính gây bệnh/bệnh cảnh lâm sàng (clinical manifestation) của các VRĐR để trở thành các tác nhân gây bệnh TCM như từng xảy ra với CV-A6.

……………, ngày…..tháng…..năm 20…..

INFORMATION ABOUT NEW FINDINGS OF THE PHD THESIS 

Title:“The molecular epidemiology of Coxsackieviruses and Echovirusesassociated with hand, foot and mouth disease in Northern, Vietnam, 2008-2018”

Specialization: Microbiology                                   Code: 9 72 07 01

Name of PhD student: Ta Thi Thu Hong

Supervisors:               1. PhD. Tran Thi Nguyen Hoa

                                    2. PhD. Duong Cong Thanh

Training Institution: National Institute of Hygiene and Epidemiology

SUMMARY OF NEW FINDINGS OF THE THESIS

1. Characteristics of non-EV-A71 enteroviruses circulating in children with HFMD in Northern Vietnam, 2008-2018

• EV-A71, CV-A6 and CV-A16 are maijor enterovirus serotypes associated with Hand food and mouth disease (HFMD) among children aged under 5 years in Vietnam. In addtion, the result also showed the importance role of non EV-A71 enteroviruses in association with HFMD, averagely accounting up to third of total enterovirs – posivive samples (1691/2603 specimens, 64,96%).
• The circulation of CV-A16 showed clear periodicity but with narrower peaks which appeared around one to two years (2014 and in 2016-2017). Similar with CV-A16, the circulation of EV-A71 showed a periodicity and the wave peaks were broadened for around two to three years (2011-2013, 2015-2016). There was negative association between the circulation of CV-A16 and EV-A71. The highest peaks of CV-A16 always concurrently occurred at the troughs of EV-A71 and in contrast, the dominance of EV-A71 occurred at the same periods of the troughs of CV-A16.
• Distribution of age group: The two recently emerging serotypes, CV-A6 and CV-A10 showed “younger-age” patterns compared with those of the typically HFMD-causative serotypes, EV-A71 and CV-A16. 

2. Molecular characteristics of VP1 region of CV-A6, CV-A16, CV-A10, CV-A2, CV-A4, E-18 and CV-A24, 2008-2018

• Phylogenetic analyses revealed that the majority of Vietnamese CV-A6 and CV-A16 strains were located within the largest subgenotypes or sub-genogroups (98,03% CV-A6specimens belonged to CV-A6_D3 and 93,89% CV-A16specimens belonged to CV-A16_B1a). These comprised strains isolated from patients with HFMD worldwide during the past decade and the Vietnamese strains have been evolving in a manner similar to the strains circulating worldwide. Amino acid sequences of the putative functional loops on VP1 and other VPs among Vietnamese CV-A6 and CV-A16 isolates were highly conserved. 77,8% of CV-A6 are “CV-A6/N137-featuring”, a dominant phenotype (62,31%) of CV-A6 globally. 80,15% CV-A16specimens bore K164mutation, a second rank phenotype (4,88%) of CV-A16 worldwide. The worldwide dominant phenotype “T164 featuring polymorphism” (72,88%) only ranked second (19,84%) among total CV-A16 strains in Northern Vietnam. The findings suggest that the development of a universal HFMD vaccine, at least in Vietnam, must target CV-A6 and CV-A16 as two of the three major HFMD-causing serotypes. Vietnamese isolates can be considered for rational vaccine design.
• The Vietnamese CV-A10 strains belonged to the biggest genotype (genotype C) that comprising isolates from patients with HFMD from several other countries. 82,61%  (38/46 strains) of the Vietnamese strains (from 2008-2018) were grouped into a local lineage (VNM lineage). In 2018, 7/13 CV-A10 strains (53,84% ) were in CHN lineage
• Vietnamese CV-A2 and CV-A4 strains were located within the global subgenotypes or sub-genogroups (88,89% specimens CV-A2 belonged sub genogroup C3 and 84,61% specimens CV-A4 belonged to of sub-genotype C2). Similar with CV-A10, they grouped in to a local lineage
• Phylogenetic analysis of completed VP1 sequences revealed that all E-18 strains belonged to the biggest sub genogroup 5-3 that contains E-18 islolated from meningitis or encephalitis patients in the world from 2014 and HFMD patients in China from 2015-2016. All Vietnamese CV-A24 belonged to sub genogroup GIV-5, the largest subgenogroup comprising CV-A24v isolated from patients with AHC worldwide.
• Study on characteritis of CV-A2, CV-A4, E-18 and CV-A24 associated with HFMD providing further evidence in the change of clinical manifestation as reported in previous studies of CV-A6

Tải file tóm tắt luận án tại đây: 

Tải file luận án tiến sĩ tại đây: 

Thông báo Bảo vệ luận án tiến sĩ cấp Viện lần thứ 326 của NCS Tạ Thị Thu Hồng

Đề tài: 

“NGHIÊN CỨU SỰ LƯU HÀNH VÀ ĐẶC ĐIỂM PHÂN TỬ CỦA MỘT SỐ VI RÚT COXSACKIE VÀ ECHO Ở TRẺ EM NGHI MẮC TAY CHÂN MIỆNG TẠI MIỀN BẮC VIỆT NAM, 2008-2018”

CHUYÊN NGÀNH: VI SINH VẬT HỌC

   MÃ SỐ:  9 42 01 07

CỦA NCS. TẠ THỊ THU HỒNG

   _VIỆN VỆ SINH DỊCH TỄ TRUNG ƯƠNG_

                               THỜI GIAN:  09 giờ 00 ngày 15 tháng 12 năm 2022

                               ĐỊA ĐIỂM TỔ CHỨC: Thư viện (tầng 3 – nhà 1) - Viện Vệ sinh dịch tễ Trung ương -

                                                             Số 1 Phố Yersin, Quận Hai Bà Trưng, Hà Nội

Trân trọng kính mời!