THÔNG TIN VỀ CÁC KẾT LUẬN MỚI CỦA LUẬN ÁN

Đề tài luận án: “Nghiên cứu kiểu gen HLA lớp I và đột biến gen HIV-1 liên quan đến tải lượng vi rút và số lượng tế bào CD4, Hà Nội, 2014-2016”

Chuyên ngành: Vi sinh vật                    Mã số: 9 42 01 07

Họ và tên nghiên cứu sinh: TRẦN THỊ MINH TÂM              Khóa đào tạo: K38

Họ và tên người hướng dẫn khoa học: 1. PGS.TS. Nguyễn Thị Lan Anh

                                                                   2. TS. Nguyễn Thùy Linh

Cơ sở đào tạo: Viện Vệ sinh dịch tễ Trung ương

Tóm tắt những kết luận mới của luận án

Kết quả Đề tài “Nghiên cứu kiểu gen HLA lớp I và đột biến gen HIV-1 liên quan đến tải lượng vi rút và số lượng tế bào CD4, Hà Nội 2014 – 2016” cho thấy:

(1) Quần thể người bệnh nhiễm HIV có đa dạng kiểu gen HLA lớp I. Sử dụng kỹ thuật xác định kiểu gen HLA với độ phân giải 4 chữ số, phát hiện được 28 alen HLA-A, 54 alen HLA-B và 35 HLA-C. Với từng locus, alen có tần suất cao nhất lần lượt là A*11:01 (0.307), B*15:02 (0.152) và C*08:01 (0.170). Tỷ lệ mang HLA đồng hợp tử là HLA-A (17.5%), HLA-B (6.6%) và HLA-C (6.9%). B*51:01 là alen duy nhất liên quan với tải lượng vi rút thấp và số lượng tế bào CD4 cao. Alen B*57:01/58:01 không có vai trò bảo vệ đối với phân típ nhiễm phân típ CRF01_AE như đã được phát hiện với nhiễm phân típ B.

(2) Phân típ HIV-1 CRF01_AE lưu hành nổi trội (98.8%), có nhiều đột biến liên kết với HLA lớp I. Tổng số 169 đột biến liên kết với 36 alen HLA lớp I được xác định trên các protein Gag (37), Nef (74), Vif (19), Vpr (18) và Vpu (21). Có nhiều đột biến liên kết HLA lớp I lần đầu tiên được xác định: chưa được công bố trên Gag (10), Nef (18) và toàn bộ đột biến Vif (19), Vpr (18) và Vpu (21) trên phân típ CRF01_AE. 

(3) Các đột biến liên kết HLA lớp I có ảnh hưởng khác nhau tới tiến triển nhiễm HIV-1 phân típ CRF01_AE.Có 6 đột biến liên kết với HLA lớp I liên quan với giảm số lượng tế bào CD4 (Gag S9-B*13:01, Gag P482-C*04:01, Nef S3-C*08:01, Nef S9-A*01:01, Nef E108-B*44:03/C*07:01) và 13 đột biến liên kết với HLA lớp I liên quan đến các mức tải lượng vi rút cao, thấp.

Hà Nội, ngày…..tháng…..năm 2023

INFORMATION ABOUT NEW FINDINGS OF THE PHD THESIS

Title: HLA class I genotypes and HLA associated HIV-1 mutation in relation to viral load and CD4 cell count in the cohort of HIV infectants, Hanoi 2014-2016

Specialization: Microbiology             Code: 9 42 01 07

Name of PhD student: TRAN THI MINH TAM

Supervisors:               1. Ass/Prof. Nguyen Thi Lan Anh

                                    2. Dr. Nguyen Thuy Linh

Training Institution:   National Institute of Hygiene and Epidemiology

SUMMARY OF NEW FINDINGS OF THE THESIS 

The thesis research showed that:

1. TheHLA class I genotypes were diversified amongst the HIV-infected populations. By HLA genotyping technique at 4-digit resolution, the total of 28 allelesHLA-A, 54 alleles HLA-B and 35 alleles HLA-C were identified. For each HLA class I locus, the most frequent alleles were A*11:01 (0.307 %), B*15:02 (0.152%), and C*08:01 (0.170%), respectively. The frequency of HLA homozygous carrier was HLA-A (17.5%), HLA-B (6.6%), and HLA-C (6.9%). In correlation with HIV viral load and CD4 cells counts, onlyB*51:01 was related with low plasma viral load and high CD4 cell count. The protective role B*57:01/58:01 in HIV infection, which was previously demonstrated with subtype B, was not observed with subtype CRF01_AE infection in this study.

2. HIV-1 subtype CRF01_AE was dominant subtype 98.8%, harboring multiple HLA class I associated mutations. The total of 169 mutations over5 HIV-1 proteins were found, including Gag (37), Nef (74), Vif (19), Vpr (18), and Vpu (21). Many HLAassociated mutations on Gag (10), Nef (18) and all mutations onVif (19), Vpr (18), Vpu (21) have been detected for the first time.

3. In relation to progression of HIV-1 subtype CRF01_AE infection, amongst HLA class I associated mutations 6 HLA associated mutationsrelated to low CD4 cell counts (Gag S9-B*13:01, Gag P482-C*04:01,Nef S3-C*08:01, Nef S9-A*01:01, Nef E108-B*44:03/C*07:01) and 13 related to (high or low) plasma viral load.

Date: August 08, 2023

Tải file tóm tắt luận án Tiếng Việt tại đây: 

Tom_tat_luan_an_TS_NCS_Tran_Thi_Minh_Tam.pdf

Tải file luận án tiến sĩ tại đây: 

Luan_an_TS_NCS_Tran_Thi_Minh_Tam.pdf