THÔNG TIN VỀ CÁC KẾT LUẬN MỚI CỦA LUẬN ÁN

Đề tài luận án: Đặc điểm phân tử SARS-CoV-2 tại miền Bắc và miền Trung Việt Nam, 2020-2021.

Chuyên ngành: Vi sinh vật học                                                 Mã số: 9 42 01 07

Họ và tên nghiên cứu sinh: Nguyễn Vũ Sơn                            Khóa đào tạo: K38

Họ và tên người hướng dẫn khoa học: 1. PGS. TS. Nguyễn Lê Khánh Hằng

                                                                   2. TS. Hoàng Vũ Mai Phương

Cơ sở đào tạo: Viện Vệ sinh dịch tễ Trung ương

Tóm tắt những kết luận mới của luận án:

1. Nghiên cứu đầu tiên công bố tổng thể sự lưu hành SARS-CoV-2 tại miền Bắc và miền Trung Việt Nam giai đoạn 2020-2021. Kết quả luận án cung cấp thông tin về đặc điểm phân tử SARS-CoV-2, cho thấy sự tương đồng của virus lưu hành tại Việt Nam và trên thế giới ở cùng thời điểm, khẳng định sự ảnh hưởng mang tính toàn cầu của SARS-CoV-2. 

2. Tỷ lệ nhiễm SARS-CoV-2 tại cộng đồng trong nghiên cứu là 1,0% thấp hơn tỷ lệ công bố của TCYTTG tại châu Âu, Đông Nam Á và châu Mỹ, là bằng chứng cho chiến lược phòng chống dịch COVID-19 tại Việt Nam giai đoạn 2020-2021 là hiệu quả. 

3. Nghiên cứu ghi nhận khả năng đào thải chậm của SARS-CoV-2 khi tỉ lệ SARS-CoV-2 dương tính 54,7% ở mẫu thứ hai, 21,2% ở mẫu thứ ba và trên 10% từ mẫu thứ 8 đến thứ 10 với khoảng cách lấy mẫu là 4 ngày.

4. Nghiên cứu đã cung cấp trình tự gen SARS-CoV-2 đầu tiên lưu hành trong cộng đồng Việt Nam lên hệ thống GISAID ngay từ thời gian đầu của vụ dịch. Đây là dữ liệu quan trọng về SARS-CoV-2 của Việt Nam được thế giới ghi nhận. 

5. Mười hai dòng virus khác nhau của SARS-CoV-2 thuộc nhóm virus Vũ Hán và 3 biến thể Alpha, Beta, Delta được ghi nhận từ kết quả của luận án. Trong đó, nhóm virus Vũ Hán được xác định có 7 dòng (19A, 19B, 20A, 20B, 20C, 20D, 20E-EU1;  biến thể Alpha có dòng 20I/501Y.V1, một dòng biến thể Beta 20H/501Y.V2 và biến thể Delta có 3 dòng (21A, 21I và 21J). Biến thể Delta AY.57 được PANGOLIN ghi nhận là biến thể đặc trưng lưu hành tại Việt Nam. Luận án lần đầu tiên áp dụng kỹ thuật giải trình tự gen thế hệ mới (NGS) để xác định các biến thể SARS-CoV-2 thâm nhập vào Việt Nam, xác định được những biến thể là căn nguyên chính của bốn làn sóng dịch trong cộng đồng tại Việt Nam. Kết quả cho thấy tính khả thi của thực hiện giám sát hệ gen của virus bằng kỹ thuật NGS. 

……………, ngày…..tháng…..năm 20…..

INFORMATION ABOUT NEW FINDINGS OF THE PHD THESIS 

Title: 

Molecular characterization of SARS-CoV-2 circulated in the North and Central provinces of Viet Nam, 2020-2021.

Specialization: Microbiology                        Code: 9 42 01 07

Name of PhD student: Nguyen Vu Son

Supervisors:               1. Asoc. Prof. Nguyen Le Khanh Hang

                                    2. Hoang Vu Mai Phuong, MD, PhD

Training Institution:   National Institute of Hygiene and Epidemiology

SUMMARY OF NEW FINDINGS OF THE THESIS 

1. The thesis reported the overall circulation of SARS-CoV-2 in the North and Central provinces of Viet Nam in the period 2020-2021. The results provided information about the molecular characteristics of SARS-CoV-2, showing the similarities of the viruses circulating in Viet Nam and around the world at the same time, confirming the global influence of SARS-CoV-2.

2. The rate of SARS-CoV-2 infection in the community in the study was 1.0%, lower than the rate (according to WHO) in Europe, Southeast Asia and the Americas, which is the evidence for the COVID-19 effective control strategy in Viet Nam during 2020-2021.

3. The study noted the persistence of SARS-CoV-2 when the positive rate was 54.7% in the second sample, 21.2% in the third sample and over 10% from the eighth to tenth sample with a sampling interval of 4 days. 

4. The study provided the first SARS-CoV-2 gene sequence which circulated in Vietnamese community to the GISAID from the beginning of the outbreak. This is important data about SARS-CoV-2 in Viet Nam recorded by the international organization.

5. Twelve different lineages of SARS-CoV-2 belonging to the Wuhan virus group and 3 variants Alpha, Beta, Delta were recorded from the thesis results. Among them, the Wuhan virus group was identified 7 lineages (19A, 19B, 20A, 20B, 20C, 20D, 20E-EU1; Alpha variant has 20I/501Y.V1 lineage, a Beta variant lineage was 20H/501Y.V2 and the Delta variant have 3 lineages (21A, 21I and 21J). The Delta AY.57 variant was recognized by PANGOLIN as a specific variant circulating in Viet Nam. The thesis applied the next generation sequencing (NGS) techniques to identify the SARS-CoV-2 variants invaded into Viet Nam, also determining the main variants caused four epidemic waves in the community in Vietnam. The results showed the feasibility of performing viral genome monitoring using NGS technology.

Tóm tắt luận án tiến sĩ của NCS Nguyễn Vũ Sơn:

Tóm_tắt_luận_án_NCS_Nguyễn_Vũ_Sơn.pdf

Luận án của NCS Nguyễn Vũ Sơn:

Luận_án_tiến_sĩ-_NCS_Nguyễn_Vũ_Sơn.pdfPhụ_lục_Luận_án_tiến_sĩ_-_NCS_Nguyễn_Vũ_Sơn.pdf

Thông báo Bảo vệ luận án tiến sĩ cấp Viện lần thứ 357 của NCS Nguyễn Vũ Sơn   

Đề tài: 

“ĐẶC ĐIỂM PHÂN TỬ CỦA SARS-COV-2 TẠI

MIỀN BẮC VÀ MIỀN TRUNG VIỆT NAM, 2020-2021”

CHUYÊN NGÀNH: VI SINH VẬT HỌC

   MÃ SỐ:  9 42 01 07

CỦA NCS. NGUYỄN VŨ SƠN

   _VIỆN VỆ SINH DỊCH TỄ TRUNG ƯƠNG_

                          THỜI GIAN:  14 giờ 00 ngày 29 tháng 7 năm 2024

                           ĐỊA ĐIỂM TỔ CHỨC: Thư viện (tầng 3 – nhà 1) - Viện Vệ sinh dịch tễ Trung ương -

                                                          Số 1 Phố Yersin, Quận Hai Bà Trưng, Hà Nội

Trân trọng kính mời!