THÔNG TIN VỀ CÁC KẾT LUẬN MỚI CỦA LUẬN ÁN

Đề tài luận án: Nghiên cứu một số đặc điểm hệ gen của các chủng vi khuẩn lao kháng thuốc phân lập từ bệnh nhân lao kháng Rifampicin tại Hà Nội năm 2020 -2022

Chuyên ngành: Vi sinh vật học                                             Mã số: 9 42 0107

Họ và tên nghiên cứu sinh: Khiếu Thị Thúy Ngọc               Khóa đào tạo: K38

Họ và tên người hướng dẫn khoa học: 1. PGS.TS.BS. Nguyễn Văn Hưng

                                                                   2. TS. Nguyễn Thị Vân Anh

Cơ sở đào tạo: Viện Vệ sinh Dịch tễ Trung ương

TÓM TẮT NHỮNG KẾT LUẬN MỚI CỦA LUẬN ÁN:

1. Quần thể nghiên cứu có tỷ lệ kháng đa thuốc (MDR-TB) là 57/82 chủng (69,5%); kháng đơn thuốc 12/82 chủng (14,6%) và tiền siêu kháng thuốc là 13/82 chủng (15.9%).

2. Giải mã trình tự hệ gene dự báo tính kháng thuốc của 82 chủng M. tuberculosis trong nghiên cứu này cho thấy độ nhậy (Se) và độ đặc hiệu (Sp) của xét nghiệm giải trình tự gene so với kháng sinh đồ kiểu hình đối các thuốc lần lượt là Isoniazid 100%, 100%; Rifampicin 100%; Ethambutol 97,2%, 67,4%; Pyrazinamide 78,4%, 96,8%; Streptomycin 95,2%, 63,2%; Moxifloxacin   37,5%, 98,5%; Amikacin 100%, 97,5%;   Kanamycin 100%, 97,5%; Capreomycin 100%, 96,3%; Tiêu chuẩn chọn mẫu nghiên cứu là mẫu đờm của bệnh nhân có kháng thuốc Rifampicin nên không có mẫu nhạy cảm để tính độ đặc hiệu của giải trình tự gene dự báo kháng thuốc Rifampicin. 

3. Phân tích mối quan hệ di truyền giữa các chủng vi khuẩn lao thu thập đượccho thấy quần thể mẫu nghiên cứu thuộc 3 dòng với tỷ lệ tương ứng là: dòng 1- EAI 4/82 (4,9%), dòng 2 – Beijing 69/82 (86,6%) vàdòng 4 -T, H, LAM 9/82 (8.5%). Các chủng dòng 2 có tỷ lệ kháng đơn thuốc 11/69 (15,9%); kháng đa thuốc 47/69 (68,1%); tiền siêu kháng thuốc 11/69 (15,9%). Đa số các chủng nghiên cứu thuộc dòng 2 – Beijing và có liên quan nhiều đến kháng đa thuốc. Cần chẩn đoán phát hiện sớm tính kháng thuốc và theo dõi dịch tễ lây truyền của các chủng vi khuẩn lao kháng thuốc để thu dung điều trị kịp thời bệnh nhân lao kháng thuốc.

Hà Nội, ngày  05  tháng 06 năm 2024

INFORMATION ABOUT NEW FINDINGS OF THE PHD THESIS 

Title: Research on the Genetic Characteristics of Drug-Resistant Tuberculosis Strains Isolated from Rifampicin-Resistant Tuberculosis Patients in Hanoi from 2020 to 2022

Specialization: Microbiology                                           Subject code: 9 42 01 07

Name of PhD student: Khieu Thi Thuy Ngoc                Study code:  K38

Supervisors:               1 Assoc. Prof. Dr. Nguyen Van Hung

                                    2. Dr. Nguyen Thi Van Anh

Training Institution:   National Institute of Hygiene and Epidemiology

SUMMARY OF NEW FINDINGS OF THE THESIS 

1. The study cohort exhibited a multi-drug resistant tuberculosis (MDR-TB) prevalence of 57/82 strains (69.5%), a mono-drug resistance prevalence of 12/82 strains (14.6%), and a pre-extensively drug-resistant tuberculosis prevalence of 13/82 strains (15.9%).

2. Whole genome sequencing for predicting drug resistance in the 82 M. tuberculosis strains demonstrated the following sensitivity (Se) and specificity (Sp) metrics when compared to phenotypic drug susceptibility testing: Isoniazid 100%, 100%; Rifampicin 100%; Ethambutol 97,2%, 67,4%; Pyrazinamide 78,4%, 96,8%; Streptomycin 95,2%, 63,2%; Moxifloxacin   37,5%, 98,5%; Amikacin 100%, 97,5%;   Kanamycin 100%, 97,5%; Capreomycin 100%, 96,3%; The selection criteria for the study samples were sputum samples from patients resistant to Rifampicin, thus there were no sensitive samples available to calculate the specificity of gene sequencing for predicting Rifampicin resistance.

3. Genetic relationship analysis of the collected tuberculosis strains revealed that the study cohort encompassed three lineages with the following distribution: Lineage 1 - EAI 4/82 (4.9%), Lineage 2 - Beijing 69/82 (86.6%), and Lineage 4 - T H LAM 9/82 (8.5%). Strains from Lineage 2 demonstrated a mono-drug resistance rate of 11/69 (15.9%), a multi-drug resistance rate of 47/69 (68.1%), and a pre-extensively drug-resistant tuberculosis rate of 11/69 (15.9%). The majority of strains belonged to Lineage 2 - Beijing, which is significantly correlated with multi-drug resistance. Early diagnosis of drug resistance and monitoring the epidemiology of drug-resistant tuberculosis strains are imperative for the timely treatment of drug-resistant tuberculosis patients.

Hanoi, June 5 , 2024

Tóm tắt luận án tiến sĩ của NCS Khiếu Thị Thúy Ngọc:

Luận án của NCS Khiếu Thị Thúy Ngọc: